1、可以约定由董事长之外的人来担任公司法定代表人

按照原公司法，公司法定代表人只能由公司董事长担任。但是在实践中往往会导致法定代表人和实际经营者不服，产生管理的混乱。

因此，如果公司实际出资人、控制人或者大股东由于各种原因不能担任董事长的，可以在公司章程中约定由董事长外的其他执行董事或由总经理担任法定代表人。这样就保护了公司控制权和经营权的灵活统一。

2、可以不按照出资比例确定分配企业利润或者新增资本有限出资的比例

有限责任公司的股东如果由于各种原因，不能按照出资比例分配红利，或者需要对特定股东给予特别的红利分配及优先认购新增资本的权利，那么可以在公司章程约定，不按照出资比例来履行股东权利义务，而是另行约定比例。

此外，对愿意通过继续认缴出资持有有限责任公司更多股权的股东，也可以在公司章程中规定其优先认缴出资的比例。这无疑保护了不同类型投资者作为公司股东的不同需求。

3、董事会和监事会的机构和组成人数更加灵活

由于公司的业务量和经营规模不同，因此，公司管理机构的组成也应当更加灵活，赋予公司自主决定权。

新公司法规定公司可以在公司章程中选择董事会和监事会的组成和规模。

其中，有限责任公司董事会成员为3～13人;股份有限公司董事会成员为5～19人,设立监事会公司的监事会成员不少于3人。

此外，对于股东人数较少或者规模较小的有限责任公司，可以选择不设监事会，而仅设1～2名监事。对于股份有限公司，新公司法中对股东大会选举董事、监事时的表决方式提供了两种选择，即公司可以在公司章程中规定或者以股东大会决议形式决定，实行累积投票制或每一股份一票表决权的普通表决方式。